El trabajo de Universal Rights Group está organizado en cuatro grandes programas. Éstos son:
- Bajo la lupa: Implementación nacional de normas universales
- Asuntos emergentes y contemporáneos
- Instituciones, mecanismos y procesos internacionales de derechos humanos
- Más allá del Consejo: La protección de los derechos humanos por fuera de los mecanismos basados en Ginebra
- Bajo la lupa: Derechos humanos y religión
Para cada uno de estos grandes programas la Junta, en sus reuniones anuales, determina una serie de proyectos específicos. Cada uno de estos proyectos es seleccionado de acuerdo a la importancia y relevancia actual de las temáticas que desarrollan, así como a su potencial para generar cambio. El programa actual de trabajo (2016-2019) incluye alrededor de 17 proyectos individuales.
Además de los cinco programas anteriormente mencionados, URG trabaja en un asunto transversal: Mejorar la visibilidad y el entendimiento del sistema internacional de derechos humanos. El enfoque en este asunto busca acercar dicho sistema internacional a los individuos a quienes está llamado a proteger, es decir, a las personas en terreno cuyos derechos han sido, o están siendo, violados y quienes necesitan apoyo y protección.